แม้จะมีสิ่งที่เราได้กล่าวไปแล้ว แต่ไม่ใช่ทุกแกนสว่างของกาแลคซีนั้นเกิดจากความหนาแน่นของดาวฤกษ์ กาแลคซีบางแห่งมีสิ่งที่เรียกว่านิวเคลียสของดาราจักรกัมมันต์แทน นิวเคลียสกาแลกติกที่ใช้งานอยู่ แอกทีฟกาแลคซีนิวเคลียส (AGN) เป็นหนึ่งในวัตถุที่สว่างที่สุดในจักรวาล  ทางช้างเผือก พื้นที่เหล่านี้เป็นใจกลางของกาแลคซีบางแห่ง ซึ่งตามชื่อของมัน มันส่องแสงในส่วนของสเปกตรัมแม่เหล็กไฟฟ้ามากกว่าที่เรามักจะเห็น AGN ไม่ใช่ต้นกำเนิดของดาวฤกษ์ แต่คิดว่าเกิดจากดิสก์สะสมของหลุมดำมวลมหาศาลที่ใจกลางกาแลคซี วัสดุในแผ่นดิสก์กำลังหมุนจนใกล้เคียงกับความเร็วแสง จนทำให้การชนมีความรุนแรงอย่างกลียุคและปล่อยพลังงานจำนวนมากออกมาอย่างน่าตกใจ กาแล็กซีส่วนใหญ่ไม่มี AGN แต่กาแล็กซีที่มี เช่นM87 ในราศีกันย์เรียกว่า Active Galaxies แกนกลางของพวกมันสามารถส่องแสงเหนือส่วนที่เหลือของกาแลคซีในช่วงความยาวคลื่นหนึ่งๆ